El juzgado se llenaba cada día de espectadores que acudían a ver a la mujer y a sus hijos, quienes habían perpetrado actos tan inconcebibles que muchos apenas se atrevían a relatar los detalles en voz alta. Caleb y Josiah Goens permanecieron en silencio durante todo el proceso; su devoción por su madre permaneció inquebrantable incluso a medida que aumentaban las pruebas de sus crímenes.
Se negaron a declarar en su propia defensa, se negaron a implicar a Eliza y no mostraron emoción alguna mientras testigo tras testigo detallaba los horrores descubiertos en su propiedad. Benjamín, el menor, enfermó poco después de su arresto; sus pulmones estaban devastados por la tuberculosis y murió en su celda antes de que concluyera el juicio, manteniendo la inocencia de su madre hasta su último aliento.
La fiscalía presentó las pruebas físicas de forma metódica: el cuerpo de Edmund Pierce con el cráneo fracturado por un golpe en la nuca, las pertenencias personales de al menos otras cuatro víctimas encontradas en el baúl cerrado con llave, y los restos del bebé, que los médicos forenses confirmaron que había nacido vivo y había fallecido a los pocos días de nacer.
Pero la prueba más contundente provino de la propia Eliza, cuya confesión fue leída íntegramente ante un tribunal sumido en un silencio atónito. Sus palabras revelaron una mente tan perturbada por el aislamiento y el engaño que había construido toda una teología para justificar lo injustificable y la había ejercido con tal autoridad que había doblegado por completo a tres hombres adultos a su voluntad.
El jurado deliberó durante menos de tres horas. Caleb y Josiah Goens fueron declarados culpables de siete cargos de asesinato y condenados a la horca. Eliza Goens fue declarada culpable de todos los cargos, pero el juez, tras escuchar el testimonio de los médicos que la habían examinado, la declaró con problemas mentales graves y ordenó su internamiento en el Hospital Estatal del Suroeste en Marion, Virginia, donde permanecería el resto de su vida.
